Kuktiškių seniūnijoje veikia 2 nevyriausybinės organizacijos: Kuktiškių seniūnijos bendruomenė ir Kuktiškių moterų kubas „Kuksa“.
Kuktiškių seniūnijos bendruomenė 2022 metais įvykdė 4 projektus:
1. Pagal Kultūrinės veiklos plėtros programos priemonę Nevyriausybinių organizacijų projektų finansavimas įgyvendintas projektas „Su Kuktiškėm širdy“. Projektas buvo vykdomas savivaldybės biudžeto lėšomis - skirta 500 Eur. Lėšos buvo panaudotos rengiant kraštiečių šventę (apmokėti koncertai, nupirktos juostos jubiliatams). Kuktiškių kraštiečių šventė buvo švenčiama rugpjūčio 13 d. 2022 m. buvo pažymėtas Kuktiškių miestelio 635 gimtadienis. Kaip ir kasmet, šventės metu buvo pasveikintas naujasis Kuktiškių Garbės pilietis - Gintautas Petravičius - aktyvus bendruomenės narys. Taip pat buvo pasveikinti seniūnijoje gyvenantys jubiliatai. Vyko šventiniai koncertai.

2. Kaimo rėmimo programos lėšomis (147 Eur) buvo apmokėtos bendruomenės patalpų išlaikymo išlaidos (draudimas, komunaliniai mokesčiai).
3. Pagal priemonę „Stiprinti bendruomeninę veiklą savivaldybėse“ buvo įgyvendintas projektas „Bendruomeniškumas ir geroji patirtis Molėtų krašte, vienijanti Kuktiškių bendruomenės narius“.
Projekto vertė 1093,16 Eur. Bendruomenės nariai aplankė Tradicinių amatų centrą ,,Meniškas kaimas“, Gurakalnės pelkę, plaukė laivu Bebrusų ežeru, dalyvavo edukacijoje.

4. Įvykdytas projektas „Tikiu jaunos kartos ateitimi“ pagal Kokybiškos švietimo sistemos kūrimas ir jaunimo užimtumo programos priemonę „Jaunimo veiklos organizacijų projektų vykdymas“. Projektas finansuotas Savivaldybės biudžeto lėšomis, projekto vertė 400 Eur. Vyko sportiniai renginiai, paskaita - susitikimas su kunigu Algirdu Toliatu.
Kuktiškių moterų kubas „Kuksa“ 2022 m. įvykdė 2 projektus:
1. 2022 m. birželio 19 d. Kuktiškių moterų klubas „Kuksa” sėkmingai baigė įgyvendinti projektą „Vaikystė - laimės šalis 6”, kurį parėmė Utenos rajono savivaldybė. Jau šeštą kartą Kuktiškėse vyko vaikų šventė - festivalis. Blogas, besikeičiantis oras nepablogino šventės kokybės, o atvirkščiai - suteikė netikėtumo ir savito žavesio. Šventės metu prasidėjus lietui, iš stadiono keliavome į sporto salę, o kai nustojo lyti vėl grįžome į lauką. Projekto vertė 500 Eur.

2. Įgyvendinant projektą „Kuktiškių moterų klubo „Kuksa" veikla, užtikrinanti bendruomeninės veiklos plėtojimą ir stiprinimą", iš Kaimo rėmimo programos lėšų apmokėtos klubo patalpų draudimo išlaidos ir banko paslaugų mokesčiai. Projekto vertė 129,00 Eur.